Tuomas-messuun kuuluu perinteisen messun pääosat: synnintunnustus, Raamatun sana ja saarna sekä ehtoollisen vietto. Rukoukselle varataan Tuomas-messussa 10 – 15 minuuttia kestävä jakso, jolloin on aikaa hyvin monenlaiselle yksityiselle rukoukselle. Tuomas-messun kulku ei ole aina samanlainen. Jokainen messu muotoutuu aiheensa ja tekijöittensä mukaan.

Tuomas-messussa lauletaan pääasiassa uudempia hengellisiä lauluja Tuomaslauluja- ja Messulauluja-kirjoista. Esilaulajana toimii kuoro ja säestyksestä huolehtii orkesteri, useimmiten oma Tuomas-kuoro ja -orkesteri.

Jokaiseen messuun tehdään käsiohjelma, josta halukkaat voivat seurata messun kulkua. Tuomas-messussa ei kuitenkaan tarvitse pelätä käyttäytyvänsä jollakin tavalla väärin. Tärkeintä on, että voi vapaasti antautua viettämään yhteistä ehtoollisjuhlaa.

Tuomas-messun kulku

ASETUMME JUMALAN ETEEN
Juontajan alkusanat
	Alkujuonnon pitää useimmiten henkilö, joka on vastannut messun valmisteluprosessista.
Ristikulkue ja laulu
	Monikymmenpäiseen alkukulkueeseen osallistuvat messussa palvelevat papit ja maallikot, jotka vain tehtävänsä puolesta voivat siihen osallistua.
Liturgin alkutervehdys
SYNNINTUNNUSTUS
Johdatus synnintunnustukseen
Synnintunnustus
	Synnintunnustuksessa viivytään ja siihen osallistuu useita alttarikaiteelle polvistuneita. Tavallisesti kaksi maallikkoa on mukana omalla synnintunnustuksellaan. Välissä on usein katumusta tukevaa soitinmusiikkia tai laulua.
Katumushiljaisuus
	Pitkän hiljaisuuden aikana on aikaa kunkin omalle itsetutkistelulle.
Synninpäästö
Ylistyslaulu
AIKAA RUKOUKSELLE
Johdatus rukoukseen
	Tämän rukousjuonnon pitää ns. esirukousjohtaja, joka on kerännyt rukousalttareiden rakentajat.
Rukousjakso
	Runsaan kymmenen minuutin ajan on mahdollisuus hyvin monenlaiseen yksityiseen rukoukseen kunkin oman tarpeen mukaan: – Voi vaeltaa rukousalttareilla ja virittyä niiden innoittamana rukoukseen. – Voi kirjoittaa oman rukouspyynnön paperille. – Voi mennä rukoilemaan valkopukuisen kanssa pääalttarille tai rippiäidin tai -isän luokse pääeteisestä. Voi omalla paikallaan keskittyä laulamaan yhteisiä rukouslauluja.
Yhteinen esirukous
	Tässä seurakuntalaisten toteuttamassa rukouksessa rukoillaan osa messussa kirjoitetuista rukouspyynnöistä. Kaikki loput pyynnöt rukoillaan eri rukouspiireissä.
SANAN AIKA
Saarnalaulu
Raamatun lukukappaleet
	Lukija:	Tämä on Jumalan Sana.
	Srk:	Kiitos Jumalalle!
Päivän evankeliumi ja Halleluja
	Lukija:	Tämä on pyhä evankeliumi.
	Srk:	Kiitos sinulle, Kristus!
Saarna
Uskontunnustus
Ilmoitus kolehdista
Kolehtilaulu
Kiitosrukous kolehdista
EHTOOLLISEN VIETTO
Vuorolaulu
	Ehtoolliseen liittyvät sävelmät jonkin verran vaihtelevat. Useimmiten ne löytyvät laulukirjan takaa.
Valmistava rukous
PYHÄ-hymni
Pyhän Hengen rukous
Ehtoollisen asettaminen
Muistelurukous
Isä meidän
Rauhantervehdys ja -toivotus
	Liturgin toivotettua seurakunnalle Herran rauhaa myös väki kirkon penkeissä voi toivottaa rauhaa toinen toisilleen.
Jumalan Karitsa
Ehtoollisen vietto
	Ehtoollista jakaa kuusi jakajaparia kirkon edessä, takana ja poikkikäytävällä, missä orkesterin puolella käytetään alkoholitonta viiniä. Pyydettäessä saa siinä myös gluteenitonta leipää. Ehtoollinen nautitaan seisten, mutta sen päätteeksi voi mennä polvistumaan alttarille.
Kiitosrukous ehtoollisesta
LÄHDEMME MAAILMAAN
Herran siunaus
Lähettäminen
Loppulaulu ja kulkue

Joka päivä, joka hetki käydä saamme voimassa Jumalan.
Joka päivä, joka hetki laulu soi pyhiinvaeltajan.